Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 SMIM26-201ENST00000411646 505 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 LINC02424-201ENST00000548512 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms