Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ARID5AQ03989 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ARID5AQ03989 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ARID5AQ03989 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
ARID5AQ03989 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARID5AQ03989 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARID5AQ03989 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARID5AQ03989 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARID5AQ03989 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARID5AQ03989 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARID5AQ03989 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARID5AQ03989 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARID5AQ03989 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARID5AQ03989 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARID5AQ03989 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARID5AQ03989 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARID5AQ03989 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARID5AQ03989 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ARID5AQ03989 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARID5AQ03989 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARID5AQ03989 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARID5AQ03989 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARID5AQ03989 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARID5AQ03989 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARID5AQ03989 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARID5AQ03989 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARID5AQ03989 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ARID5AQ03989 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARID5AQ03989 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARID5AQ03989 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms