Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms