Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN15P56746 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN15P56746 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN15P56746 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN15P56746 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN15P56746 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN15P56746 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN15P56746 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN15P56746 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN15P56746 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN15P56746 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN15P56746 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN15P56746 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN15P56746 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN15P56746 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN15P56746 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN15P56746 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN15P56746 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN15P56746 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN15P56746 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN15P56746 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN15P56746 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN15P56746 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN15P56746 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN15P56746 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN15P56746 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN15P56746 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN15P56746 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN15P56746 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms