Protein–RNA interactions for Protein: P54920

NAPA, Alpha-soluble NSF attachment protein, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAPAP54920 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAPAP54920 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAPAP54920 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAPAP54920 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAPAP54920 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAPAP54920 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAPAP54920 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAPAP54920 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAPAP54920 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAPAP54920 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAPAP54920 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAPAP54920 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAPAP54920 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAPAP54920 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAPAP54920 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAPAP54920 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NAPAP54920 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAPAP54920 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAPAP54920 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAPAP54920 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAPAP54920 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAPAP54920 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAPAP54920 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAPAP54920 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAPAP54920 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAPAP54920 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAPAP54920 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAPAP54920 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAPAP54920 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAPAP54920 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAPAP54920 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAPAP54920 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAPAP54920 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAPAP54920 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAPAP54920 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAPAP54920 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAPAP54920 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAPAP54920 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAPAP54920 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAPAP54920 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAPAP54920 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAPAP54920 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NAPAP54920 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAPAP54920 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAPAP54920 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAPAP54920 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NAPAP54920 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAPAP54920 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAPAP54920 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAPAP54920 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAPAP54920 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAPAP54920 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAPAP54920 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAPAP54920 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NAPAP54920 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NAPAP54920 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NAPAP54920 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NAPAP54920 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NAPAP54920 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NAPAP54920 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NAPAP54920 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NAPAP54920 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NAPAP54920 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NAPAP54920 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NAPAP54920 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NAPAP54920 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NAPAP54920 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NAPAP54920 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NAPAP54920 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NAPAP54920 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NAPAP54920 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NAPAP54920 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NAPAP54920 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NAPAP54920 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NAPAP54920 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NAPAP54920 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NAPAP54920 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NAPAP54920 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NAPAP54920 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAPAP54920 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAPAP54920 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAPAP54920 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAPAP54920 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAPAP54920 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAPAP54920 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAPAP54920 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAPAP54920 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAPAP54920 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAPAP54920 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAPAP54920 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAPAP54920 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAPAP54920 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAPAP54920 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAPAP54920 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAPAP54920 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAPAP54920 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NAPAP54920 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAPAP54920 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAPAP54920 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAPAP54920 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms