Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MVDP53602 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MVDP53602 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MVDP53602 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MVDP53602 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MVDP53602 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MVDP53602 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MVDP53602 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MVDP53602 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MVDP53602 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MVDP53602 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MVDP53602 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MVDP53602 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MVDP53602 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MVDP53602 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MVDP53602 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MVDP53602 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MVDP53602 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MVDP53602 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MVDP53602 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MVDP53602 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MVDP53602 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MVDP53602 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MVDP53602 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MVDP53602 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MVDP53602 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MVDP53602 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MVDP53602 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MVDP53602 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MVDP53602 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MVDP53602 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MVDP53602 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MVDP53602 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MVDP53602 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MVDP53602 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MVDP53602 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MVDP53602 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MVDP53602 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MVDP53602 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MVDP53602 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MVDP53602 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MVDP53602 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MVDP53602 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MVDP53602 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MVDP53602 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MVDP53602 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MVDP53602 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MVDP53602 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MVDP53602 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MVDP53602 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MVDP53602 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MVDP53602 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MVDP53602 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MVDP53602 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MVDP53602 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MVDP53602 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MVDP53602 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MVDP53602 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MVDP53602 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MVDP53602 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MVDP53602 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MVDP53602 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MVDP53602 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MVDP53602 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MVDP53602 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MVDP53602 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MVDP53602 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MVDP53602 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MVDP53602 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MVDP53602 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MVDP53602 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MVDP53602 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MVDP53602 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MVDP53602 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MVDP53602 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MVDP53602 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MVDP53602 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MVDP53602 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MVDP53602 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MVDP53602 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MVDP53602 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MVDP53602 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MVDP53602 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MVDP53602 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MVDP53602 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MVDP53602 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MVDP53602 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MVDP53602 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MVDP53602 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MVDP53602 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MVDP53602 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MVDP53602 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MVDP53602 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MVDP53602 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MVDP53602 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MVDP53602 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MVDP53602 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MVDP53602 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MVDP53602 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MVDP53602 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms