Protein–RNA interactions for Protein: P47224

RABIF, Guanine nucleotide exchange factor MSS4, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABIFP47224 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABIFP47224 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABIFP47224 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABIFP47224 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABIFP47224 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABIFP47224 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABIFP47224 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RABIFP47224 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RABIFP47224 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RABIFP47224 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RABIFP47224 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RABIFP47224 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RABIFP47224 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RABIFP47224 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RABIFP47224 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RABIFP47224 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RABIFP47224 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RABIFP47224 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RABIFP47224 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RABIFP47224 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RABIFP47224 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RABIFP47224 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RABIFP47224 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RABIFP47224 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RABIFP47224 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RABIFP47224 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RABIFP47224 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RABIFP47224 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RABIFP47224 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RABIFP47224 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RABIFP47224 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RABIFP47224 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RABIFP47224 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RABIFP47224 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABIFP47224 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABIFP47224 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABIFP47224 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABIFP47224 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABIFP47224 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABIFP47224 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABIFP47224 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABIFP47224 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABIFP47224 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABIFP47224 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABIFP47224 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABIFP47224 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABIFP47224 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABIFP47224 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABIFP47224 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABIFP47224 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABIFP47224 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABIFP47224 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABIFP47224 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABIFP47224 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABIFP47224 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABIFP47224 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABIFP47224 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABIFP47224 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABIFP47224 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABIFP47224 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABIFP47224 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RABIFP47224 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RABIFP47224 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RABIFP47224 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RABIFP47224 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RABIFP47224 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RABIFP47224 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RABIFP47224 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RABIFP47224 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RABIFP47224 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RABIFP47224 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RABIFP47224 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RABIFP47224 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RABIFP47224 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RABIFP47224 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RABIFP47224 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RABIFP47224 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RABIFP47224 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RABIFP47224 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RABIFP47224 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RABIFP47224 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RABIFP47224 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RABIFP47224 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RABIFP47224 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RABIFP47224 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RABIFP47224 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RABIFP47224 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RABIFP47224 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RABIFP47224 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RABIFP47224 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RABIFP47224 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RABIFP47224 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RABIFP47224 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RABIFP47224 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RABIFP47224 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RABIFP47224 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RABIFP47224 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RABIFP47224 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RABIFP47224 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RABIFP47224 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms