Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGB2P26583 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms