Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms