Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms