Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms