Protein–RNA interactions for Protein: P0DP01

IGHV1-8, Immunoglobulin heavy variable 1-8, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-8P0DP01 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IGHV1-8P0DP01 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms