Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms