Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ZNF888P0CJ79 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ZNF888P0CJ79 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ZNF888P0CJ79 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ZNF888P0CJ79 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF888P0CJ79 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF888P0CJ79 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF888P0CJ79 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF888P0CJ79 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF888P0CJ79 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF888P0CJ79 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF888P0CJ79 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF888P0CJ79 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF888P0CJ79 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF888P0CJ79 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF888P0CJ79 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF888P0CJ79 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms