Protein–RNA interactions for Protein: O75530

EED, Polycomb protein EED, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEDO75530 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EEDO75530 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EEDO75530 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
EEDO75530 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EEDO75530 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EEDO75530 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EEDO75530 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EEDO75530 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EEDO75530 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EEDO75530 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EEDO75530 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EEDO75530 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EEDO75530 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EEDO75530 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EEDO75530 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
EEDO75530 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EEDO75530 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EEDO75530 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EEDO75530 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EEDO75530 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EEDO75530 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EEDO75530 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EEDO75530 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EEDO75530 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EEDO75530 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EEDO75530 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EEDO75530 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EEDO75530 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EEDO75530 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EEDO75530 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EEDO75530 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EEDO75530 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EEDO75530 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EEDO75530 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EEDO75530 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EEDO75530 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EEDO75530 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEDO75530 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEDO75530 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEDO75530 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEDO75530 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEDO75530 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEDO75530 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEDO75530 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEDO75530 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEDO75530 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEDO75530 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEDO75530 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEDO75530 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEDO75530 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEDO75530 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEDO75530 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEDO75530 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEDO75530 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEDO75530 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEDO75530 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEDO75530 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEDO75530 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EEDO75530 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EEDO75530 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EEDO75530 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EEDO75530 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EEDO75530 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EEDO75530 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EEDO75530 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EEDO75530 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EEDO75530 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EEDO75530 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EEDO75530 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EEDO75530 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EEDO75530 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EEDO75530 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EEDO75530 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EEDO75530 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EEDO75530 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EEDO75530 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EEDO75530 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EEDO75530 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EEDO75530 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EEDO75530 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EEDO75530 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EEDO75530 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EEDO75530 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EEDO75530 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EEDO75530 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
EEDO75530 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EEDO75530 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EEDO75530 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EEDO75530 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EEDO75530 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EEDO75530 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EEDO75530 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EEDO75530 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EEDO75530 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EEDO75530 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EEDO75530 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EEDO75530 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EEDO75530 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EEDO75530 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EEDO75530 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms