Protein–RNA interactions for Protein: O75177

SS18L1, Calcium-responsive transactivator, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L1O75177 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SS18L1O75177 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms