Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSVO60911 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSVO60911 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSVO60911 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSVO60911 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSVO60911 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSVO60911 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSVO60911 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSVO60911 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSVO60911 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSVO60911 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSVO60911 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSVO60911 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSVO60911 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSVO60911 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSVO60911 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSVO60911 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSVO60911 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSVO60911 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSVO60911 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSVO60911 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSVO60911 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSVO60911 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSVO60911 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSVO60911 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTSVO60911 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTSVO60911 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTSVO60911 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTSVO60911 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTSVO60911 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTSVO60911 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTSVO60911 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTSVO60911 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTSVO60911 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTSVO60911 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTSVO60911 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTSVO60911 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTSVO60911 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTSVO60911 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTSVO60911 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTSVO60911 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTSVO60911 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTSVO60911 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CTSVO60911 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTSVO60911 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTSVO60911 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTSVO60911 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTSVO60911 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTSVO60911 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTSVO60911 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTSVO60911 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTSVO60911 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTSVO60911 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSVO60911 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSVO60911 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSVO60911 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSVO60911 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSVO60911 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSVO60911 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSVO60911 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSVO60911 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSVO60911 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSVO60911 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSVO60911 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSVO60911 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSVO60911 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSVO60911 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSVO60911 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSVO60911 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSVO60911 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSVO60911 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSVO60911 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSVO60911 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSVO60911 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSVO60911 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSVO60911 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSVO60911 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSVO60911 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSVO60911 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSVO60911 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSVO60911 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSVO60911 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSVO60911 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSVO60911 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSVO60911 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSVO60911 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSVO60911 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTSVO60911 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTSVO60911 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTSVO60911 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTSVO60911 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTSVO60911 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTSVO60911 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTSVO60911 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTSVO60911 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTSVO60911 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CTSVO60911 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTSVO60911 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTSVO60911 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTSVO60911 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms