Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms