Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NFKBIEO00221 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms