Protein–RNA interactions for Protein: H3BUK9

POTEB2, POTE ankyrin domain family member B2, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB2H3BUK9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.28■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.28■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.27■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.27■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POTEB2H3BUK9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
POTEB2H3BUK9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
POTEB2H3BUK9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
POTEB2H3BUK9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
POTEB2H3BUK9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POTEB2H3BUK9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POTEB2H3BUK9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POTEB2H3BUK9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POTEB2H3BUK9 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POTEB2H3BUK9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POTEB2H3BUK9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POTEB2H3BUK9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POTEB2H3BUK9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POTEB2H3BUK9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POTEB2H3BUK9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POTEB2H3BUK9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POTEB2H3BUK9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POTEB2H3BUK9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POTEB2H3BUK9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POTEB2H3BUK9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POTEB2H3BUK9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POTEB2H3BUK9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POTEB2H3BUK9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POTEB2H3BUK9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POTEB2H3BUK9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POTEB2H3BUK9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POTEB2H3BUK9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POTEB2H3BUK9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POTEB2H3BUK9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POTEB2H3BUK9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POTEB2H3BUK9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POTEB2H3BUK9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms