Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PATL2C9JE40 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms