Protein–RNA interactions for Protein: A6NMT0

DBX1, Homeobox protein DBX1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBX1A6NMT0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms