Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEMP2A6NFY4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NEMP2A6NFY4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms