Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms