Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUBP2Q9Y5Y2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NUBP2Q9Y5Y2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUBP2Q9Y5Y2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUBP2Q9Y5Y2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUBP2Q9Y5Y2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUBP2Q9Y5Y2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NUBP2Q9Y5Y2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUBP2Q9Y5Y2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUBP2Q9Y5Y2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUBP2Q9Y5Y2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUBP2Q9Y5Y2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUBP2Q9Y5Y2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUBP2Q9Y5Y2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUBP2Q9Y5Y2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUBP2Q9Y5Y2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUBP2Q9Y5Y2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUBP2Q9Y5Y2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUBP2Q9Y5Y2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUBP2Q9Y5Y2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUBP2Q9Y5Y2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUBP2Q9Y5Y2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUBP2Q9Y5Y2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NUBP2Q9Y5Y2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NUBP2Q9Y5Y2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NUBP2Q9Y5Y2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NUBP2Q9Y5Y2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUBP2Q9Y5Y2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NUBP2Q9Y5Y2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUBP2Q9Y5Y2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NUBP2Q9Y5Y2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NUBP2Q9Y5Y2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUBP2Q9Y5Y2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUBP2Q9Y5Y2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NUBP2Q9Y5Y2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NUBP2Q9Y5Y2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUBP2Q9Y5Y2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NUBP2Q9Y5Y2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NUBP2Q9Y5Y2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NUBP2Q9Y5Y2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NUBP2Q9Y5Y2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NUBP2Q9Y5Y2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUBP2Q9Y5Y2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NUBP2Q9Y5Y2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUBP2Q9Y5Y2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NUBP2Q9Y5Y2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NUBP2Q9Y5Y2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NUBP2Q9Y5Y2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUBP2Q9Y5Y2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUBP2Q9Y5Y2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NUBP2Q9Y5Y2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NUBP2Q9Y5Y2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUBP2Q9Y5Y2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NUBP2Q9Y5Y2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NUBP2Q9Y5Y2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NUBP2Q9Y5Y2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUBP2Q9Y5Y2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUBP2Q9Y5Y2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUBP2Q9Y5Y2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUBP2Q9Y5Y2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUBP2Q9Y5Y2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUBP2Q9Y5Y2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUBP2Q9Y5Y2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NUBP2Q9Y5Y2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUBP2Q9Y5Y2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUBP2Q9Y5Y2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUBP2Q9Y5Y2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUBP2Q9Y5Y2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUBP2Q9Y5Y2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUBP2Q9Y5Y2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUBP2Q9Y5Y2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUBP2Q9Y5Y2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUBP2Q9Y5Y2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUBP2Q9Y5Y2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUBP2Q9Y5Y2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUBP2Q9Y5Y2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUBP2Q9Y5Y2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUBP2Q9Y5Y2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUBP2Q9Y5Y2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUBP2Q9Y5Y2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUBP2Q9Y5Y2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUBP2Q9Y5Y2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUBP2Q9Y5Y2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUBP2Q9Y5Y2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUBP2Q9Y5Y2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUBP2Q9Y5Y2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUBP2Q9Y5Y2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUBP2Q9Y5Y2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUBP2Q9Y5Y2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUBP2Q9Y5Y2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUBP2Q9Y5Y2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUBP2Q9Y5Y2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUBP2Q9Y5Y2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUBP2Q9Y5Y2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUBP2Q9Y5Y2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUBP2Q9Y5Y2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUBP2Q9Y5Y2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUBP2Q9Y5Y2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms