Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W9

SNX11, Sorting nexin-11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11Q9Y5W9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX11Q9Y5W9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX11Q9Y5W9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX11Q9Y5W9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX11Q9Y5W9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX11Q9Y5W9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX11Q9Y5W9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX11Q9Y5W9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX11Q9Y5W9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX11Q9Y5W9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX11Q9Y5W9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX11Q9Y5W9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SNX11Q9Y5W9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SNX11Q9Y5W9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX11Q9Y5W9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX11Q9Y5W9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX11Q9Y5W9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX11Q9Y5W9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX11Q9Y5W9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX11Q9Y5W9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX11Q9Y5W9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX11Q9Y5W9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX11Q9Y5W9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX11Q9Y5W9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX11Q9Y5W9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX11Q9Y5W9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX11Q9Y5W9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX11Q9Y5W9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX11Q9Y5W9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX11Q9Y5W9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX11Q9Y5W9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX11Q9Y5W9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX11Q9Y5W9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX11Q9Y5W9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX11Q9Y5W9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX11Q9Y5W9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX11Q9Y5W9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX11Q9Y5W9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX11Q9Y5W9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX11Q9Y5W9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX11Q9Y5W9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX11Q9Y5W9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX11Q9Y5W9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX11Q9Y5W9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX11Q9Y5W9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX11Q9Y5W9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX11Q9Y5W9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX11Q9Y5W9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX11Q9Y5W9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX11Q9Y5W9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX11Q9Y5W9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX11Q9Y5W9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX11Q9Y5W9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX11Q9Y5W9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX11Q9Y5W9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX11Q9Y5W9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX11Q9Y5W9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX11Q9Y5W9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX11Q9Y5W9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX11Q9Y5W9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX11Q9Y5W9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX11Q9Y5W9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX11Q9Y5W9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX11Q9Y5W9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX11Q9Y5W9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX11Q9Y5W9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX11Q9Y5W9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX11Q9Y5W9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX11Q9Y5W9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX11Q9Y5W9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX11Q9Y5W9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX11Q9Y5W9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX11Q9Y5W9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX11Q9Y5W9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX11Q9Y5W9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX11Q9Y5W9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX11Q9Y5W9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX11Q9Y5W9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX11Q9Y5W9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX11Q9Y5W9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX11Q9Y5W9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX11Q9Y5W9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX11Q9Y5W9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX11Q9Y5W9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX11Q9Y5W9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX11Q9Y5W9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX11Q9Y5W9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX11Q9Y5W9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX11Q9Y5W9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX11Q9Y5W9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX11Q9Y5W9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX11Q9Y5W9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX11Q9Y5W9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX11Q9Y5W9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX11Q9Y5W9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX11Q9Y5W9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX11Q9Y5W9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX11Q9Y5W9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX11Q9Y5W9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX11Q9Y5W9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.5 ms