Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W3

KLF2, Krueppel-like factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF2Q9Y5W3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLF2Q9Y5W3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLF2Q9Y5W3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLF2Q9Y5W3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLF2Q9Y5W3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLF2Q9Y5W3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLF2Q9Y5W3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF2Q9Y5W3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF2Q9Y5W3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF2Q9Y5W3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF2Q9Y5W3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF2Q9Y5W3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF2Q9Y5W3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF2Q9Y5W3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF2Q9Y5W3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF2Q9Y5W3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KLF2Q9Y5W3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLF2Q9Y5W3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLF2Q9Y5W3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLF2Q9Y5W3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLF2Q9Y5W3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLF2Q9Y5W3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLF2Q9Y5W3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLF2Q9Y5W3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLF2Q9Y5W3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLF2Q9Y5W3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLF2Q9Y5W3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLF2Q9Y5W3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KLF2Q9Y5W3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF2Q9Y5W3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF2Q9Y5W3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF2Q9Y5W3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF2Q9Y5W3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLF2Q9Y5W3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLF2Q9Y5W3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLF2Q9Y5W3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLF2Q9Y5W3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLF2Q9Y5W3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLF2Q9Y5W3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLF2Q9Y5W3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLF2Q9Y5W3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLF2Q9Y5W3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLF2Q9Y5W3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLF2Q9Y5W3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLF2Q9Y5W3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KLF2Q9Y5W3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLF2Q9Y5W3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLF2Q9Y5W3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLF2Q9Y5W3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLF2Q9Y5W3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLF2Q9Y5W3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLF2Q9Y5W3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLF2Q9Y5W3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLF2Q9Y5W3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLF2Q9Y5W3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLF2Q9Y5W3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLF2Q9Y5W3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLF2Q9Y5W3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF2Q9Y5W3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF2Q9Y5W3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF2Q9Y5W3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF2Q9Y5W3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF2Q9Y5W3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF2Q9Y5W3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF2Q9Y5W3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLF2Q9Y5W3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLF2Q9Y5W3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLF2Q9Y5W3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLF2Q9Y5W3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLF2Q9Y5W3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLF2Q9Y5W3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLF2Q9Y5W3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLF2Q9Y5W3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLF2Q9Y5W3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLF2Q9Y5W3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KLF2Q9Y5W3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLF2Q9Y5W3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLF2Q9Y5W3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLF2Q9Y5W3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLF2Q9Y5W3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLF2Q9Y5W3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLF2Q9Y5W3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLF2Q9Y5W3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLF2Q9Y5W3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLF2Q9Y5W3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLF2Q9Y5W3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLF2Q9Y5W3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLF2Q9Y5W3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KLF2Q9Y5W3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KLF2Q9Y5W3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLF2Q9Y5W3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLF2Q9Y5W3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLF2Q9Y5W3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLF2Q9Y5W3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLF2Q9Y5W3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLF2Q9Y5W3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLF2Q9Y5W3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLF2Q9Y5W3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLF2Q9Y5W3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLF2Q9Y5W3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms