Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E1

PCDHB9, Protocadherin beta-9, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB9Q9Y5E1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHB9Q9Y5E1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHB9Q9Y5E1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHB9Q9Y5E1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHB9Q9Y5E1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB9Q9Y5E1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB9Q9Y5E1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB9Q9Y5E1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHB9Q9Y5E1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHB9Q9Y5E1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHB9Q9Y5E1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHB9Q9Y5E1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHB9Q9Y5E1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHB9Q9Y5E1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHB9Q9Y5E1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHB9Q9Y5E1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHB9Q9Y5E1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHB9Q9Y5E1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHB9Q9Y5E1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB9Q9Y5E1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB9Q9Y5E1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB9Q9Y5E1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB9Q9Y5E1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB9Q9Y5E1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB9Q9Y5E1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB9Q9Y5E1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB9Q9Y5E1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB9Q9Y5E1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB9Q9Y5E1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB9Q9Y5E1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB9Q9Y5E1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB9Q9Y5E1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PCDHB9Q9Y5E1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB9Q9Y5E1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB9Q9Y5E1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB9Q9Y5E1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB9Q9Y5E1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB9Q9Y5E1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB9Q9Y5E1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB9Q9Y5E1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB9Q9Y5E1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB9Q9Y5E1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB9Q9Y5E1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB9Q9Y5E1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHB9Q9Y5E1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHB9Q9Y5E1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHB9Q9Y5E1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHB9Q9Y5E1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHB9Q9Y5E1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHB9Q9Y5E1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHB9Q9Y5E1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB9Q9Y5E1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB9Q9Y5E1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB9Q9Y5E1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHB9Q9Y5E1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHB9Q9Y5E1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHB9Q9Y5E1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHB9Q9Y5E1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHB9Q9Y5E1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHB9Q9Y5E1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHB9Q9Y5E1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHB9Q9Y5E1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHB9Q9Y5E1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB9Q9Y5E1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB9Q9Y5E1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB9Q9Y5E1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB9Q9Y5E1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHB9Q9Y5E1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHB9Q9Y5E1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB9Q9Y5E1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB9Q9Y5E1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHB9Q9Y5E1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHB9Q9Y5E1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHB9Q9Y5E1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHB9Q9Y5E1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB9Q9Y5E1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB9Q9Y5E1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB9Q9Y5E1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB9Q9Y5E1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB9Q9Y5E1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB9Q9Y5E1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB9Q9Y5E1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB9Q9Y5E1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB9Q9Y5E1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB9Q9Y5E1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB9Q9Y5E1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB9Q9Y5E1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB9Q9Y5E1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB9Q9Y5E1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PCDHB9Q9Y5E1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB9Q9Y5E1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB9Q9Y5E1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB9Q9Y5E1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB9Q9Y5E1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB9Q9Y5E1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB9Q9Y5E1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB9Q9Y5E1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHB9Q9Y5E1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHB9Q9Y5E1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHB9Q9Y5E1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms