Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3R0

GRIP1, Glutamate receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIP1Q9Y3R0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIP1Q9Y3R0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIP1Q9Y3R0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIP1Q9Y3R0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIP1Q9Y3R0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIP1Q9Y3R0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIP1Q9Y3R0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIP1Q9Y3R0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIP1Q9Y3R0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIP1Q9Y3R0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIP1Q9Y3R0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIP1Q9Y3R0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIP1Q9Y3R0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIP1Q9Y3R0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIP1Q9Y3R0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIP1Q9Y3R0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIP1Q9Y3R0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIP1Q9Y3R0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIP1Q9Y3R0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIP1Q9Y3R0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIP1Q9Y3R0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIP1Q9Y3R0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIP1Q9Y3R0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIP1Q9Y3R0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIP1Q9Y3R0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIP1Q9Y3R0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIP1Q9Y3R0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIP1Q9Y3R0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIP1Q9Y3R0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIP1Q9Y3R0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIP1Q9Y3R0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIP1Q9Y3R0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIP1Q9Y3R0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIP1Q9Y3R0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIP1Q9Y3R0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIP1Q9Y3R0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIP1Q9Y3R0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIP1Q9Y3R0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIP1Q9Y3R0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIP1Q9Y3R0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIP1Q9Y3R0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIP1Q9Y3R0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIP1Q9Y3R0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIP1Q9Y3R0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIP1Q9Y3R0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIP1Q9Y3R0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIP1Q9Y3R0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIP1Q9Y3R0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIP1Q9Y3R0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIP1Q9Y3R0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIP1Q9Y3R0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIP1Q9Y3R0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIP1Q9Y3R0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIP1Q9Y3R0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIP1Q9Y3R0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIP1Q9Y3R0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIP1Q9Y3R0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIP1Q9Y3R0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIP1Q9Y3R0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIP1Q9Y3R0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIP1Q9Y3R0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIP1Q9Y3R0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIP1Q9Y3R0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIP1Q9Y3R0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIP1Q9Y3R0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIP1Q9Y3R0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIP1Q9Y3R0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIP1Q9Y3R0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIP1Q9Y3R0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIP1Q9Y3R0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIP1Q9Y3R0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIP1Q9Y3R0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIP1Q9Y3R0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIP1Q9Y3R0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIP1Q9Y3R0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIP1Q9Y3R0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIP1Q9Y3R0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIP1Q9Y3R0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIP1Q9Y3R0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIP1Q9Y3R0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIP1Q9Y3R0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIP1Q9Y3R0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIP1Q9Y3R0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIP1Q9Y3R0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIP1Q9Y3R0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIP1Q9Y3R0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIP1Q9Y3R0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIP1Q9Y3R0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIP1Q9Y3R0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIP1Q9Y3R0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIP1Q9Y3R0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIP1Q9Y3R0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIP1Q9Y3R0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIP1Q9Y3R0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIP1Q9Y3R0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIP1Q9Y3R0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIP1Q9Y3R0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIP1Q9Y3R0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIP1Q9Y3R0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIP1Q9Y3R0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms