Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y9

KLF13, Krueppel-like factor 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF13Q9Y2Y9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLF13Q9Y2Y9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLF13Q9Y2Y9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLF13Q9Y2Y9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLF13Q9Y2Y9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLF13Q9Y2Y9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLF13Q9Y2Y9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLF13Q9Y2Y9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLF13Q9Y2Y9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLF13Q9Y2Y9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KLF13Q9Y2Y9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KLF13Q9Y2Y9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLF13Q9Y2Y9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLF13Q9Y2Y9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KLF13Q9Y2Y9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLF13Q9Y2Y9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLF13Q9Y2Y9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLF13Q9Y2Y9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLF13Q9Y2Y9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLF13Q9Y2Y9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLF13Q9Y2Y9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLF13Q9Y2Y9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLF13Q9Y2Y9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLF13Q9Y2Y9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLF13Q9Y2Y9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLF13Q9Y2Y9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLF13Q9Y2Y9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLF13Q9Y2Y9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KLF13Q9Y2Y9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLF13Q9Y2Y9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLF13Q9Y2Y9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLF13Q9Y2Y9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLF13Q9Y2Y9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLF13Q9Y2Y9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLF13Q9Y2Y9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLF13Q9Y2Y9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KLF13Q9Y2Y9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLF13Q9Y2Y9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLF13Q9Y2Y9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLF13Q9Y2Y9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLF13Q9Y2Y9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLF13Q9Y2Y9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLF13Q9Y2Y9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KLF13Q9Y2Y9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KLF13Q9Y2Y9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLF13Q9Y2Y9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLF13Q9Y2Y9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KLF13Q9Y2Y9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLF13Q9Y2Y9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLF13Q9Y2Y9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLF13Q9Y2Y9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLF13Q9Y2Y9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLF13Q9Y2Y9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLF13Q9Y2Y9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLF13Q9Y2Y9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLF13Q9Y2Y9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLF13Q9Y2Y9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLF13Q9Y2Y9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLF13Q9Y2Y9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLF13Q9Y2Y9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLF13Q9Y2Y9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLF13Q9Y2Y9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLF13Q9Y2Y9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLF13Q9Y2Y9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLF13Q9Y2Y9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLF13Q9Y2Y9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLF13Q9Y2Y9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KLF13Q9Y2Y9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLF13Q9Y2Y9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLF13Q9Y2Y9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLF13Q9Y2Y9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KLF13Q9Y2Y9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLF13Q9Y2Y9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLF13Q9Y2Y9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLF13Q9Y2Y9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLF13Q9Y2Y9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLF13Q9Y2Y9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLF13Q9Y2Y9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLF13Q9Y2Y9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLF13Q9Y2Y9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLF13Q9Y2Y9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLF13Q9Y2Y9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLF13Q9Y2Y9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLF13Q9Y2Y9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLF13Q9Y2Y9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLF13Q9Y2Y9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KLF13Q9Y2Y9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLF13Q9Y2Y9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLF13Q9Y2Y9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLF13Q9Y2Y9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KLF13Q9Y2Y9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLF13Q9Y2Y9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLF13Q9Y2Y9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLF13Q9Y2Y9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KLF13Q9Y2Y9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLF13Q9Y2Y9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLF13Q9Y2Y9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLF13Q9Y2Y9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KLF13Q9Y2Y9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KLF13Q9Y2Y9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms