Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W6

TDRKH, Tudor and KH domain-containing protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRKHQ9Y2W6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TDRKHQ9Y2W6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TDRKHQ9Y2W6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TDRKHQ9Y2W6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TDRKHQ9Y2W6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TDRKHQ9Y2W6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TDRKHQ9Y2W6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TDRKHQ9Y2W6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TDRKHQ9Y2W6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TDRKHQ9Y2W6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TDRKHQ9Y2W6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TDRKHQ9Y2W6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TDRKHQ9Y2W6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TDRKHQ9Y2W6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TDRKHQ9Y2W6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TDRKHQ9Y2W6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TDRKHQ9Y2W6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TDRKHQ9Y2W6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TDRKHQ9Y2W6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TDRKHQ9Y2W6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
TDRKHQ9Y2W6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
TDRKHQ9Y2W6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TDRKHQ9Y2W6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TDRKHQ9Y2W6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDRKHQ9Y2W6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDRKHQ9Y2W6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDRKHQ9Y2W6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDRKHQ9Y2W6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDRKHQ9Y2W6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRKHQ9Y2W6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRKHQ9Y2W6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRKHQ9Y2W6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRKHQ9Y2W6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRKHQ9Y2W6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRKHQ9Y2W6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRKHQ9Y2W6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRKHQ9Y2W6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRKHQ9Y2W6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRKHQ9Y2W6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRKHQ9Y2W6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRKHQ9Y2W6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRKHQ9Y2W6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TDRKHQ9Y2W6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TDRKHQ9Y2W6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TDRKHQ9Y2W6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TDRKHQ9Y2W6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TDRKHQ9Y2W6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TDRKHQ9Y2W6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TDRKHQ9Y2W6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TDRKHQ9Y2W6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TDRKHQ9Y2W6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TDRKHQ9Y2W6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TDRKHQ9Y2W6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TDRKHQ9Y2W6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TDRKHQ9Y2W6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TDRKHQ9Y2W6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TDRKHQ9Y2W6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TDRKHQ9Y2W6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TDRKHQ9Y2W6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDRKHQ9Y2W6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDRKHQ9Y2W6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDRKHQ9Y2W6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDRKHQ9Y2W6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDRKHQ9Y2W6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDRKHQ9Y2W6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDRKHQ9Y2W6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDRKHQ9Y2W6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDRKHQ9Y2W6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDRKHQ9Y2W6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDRKHQ9Y2W6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDRKHQ9Y2W6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDRKHQ9Y2W6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDRKHQ9Y2W6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TDRKHQ9Y2W6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TDRKHQ9Y2W6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRKHQ9Y2W6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRKHQ9Y2W6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRKHQ9Y2W6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRKHQ9Y2W6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRKHQ9Y2W6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRKHQ9Y2W6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRKHQ9Y2W6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRKHQ9Y2W6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRKHQ9Y2W6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRKHQ9Y2W6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRKHQ9Y2W6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRKHQ9Y2W6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRKHQ9Y2W6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRKHQ9Y2W6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRKHQ9Y2W6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRKHQ9Y2W6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRKHQ9Y2W6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRKHQ9Y2W6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TDRKHQ9Y2W6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TDRKHQ9Y2W6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TDRKHQ9Y2W6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TDRKHQ9Y2W6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TDRKHQ9Y2W6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TDRKHQ9Y2W6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TDRKHQ9Y2W6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.8 ms