Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y228

TRAF3IP3, TRAF3-interacting JNK-activating modulator, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP3Q9Y228 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAF3IP3Q9Y228 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAF3IP3Q9Y228 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAF3IP3Q9Y228 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAF3IP3Q9Y228 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAF3IP3Q9Y228 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAF3IP3Q9Y228 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAF3IP3Q9Y228 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAF3IP3Q9Y228 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRAF3IP3Q9Y228 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAF3IP3Q9Y228 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAF3IP3Q9Y228 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAF3IP3Q9Y228 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAF3IP3Q9Y228 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAF3IP3Q9Y228 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAF3IP3Q9Y228 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAF3IP3Q9Y228 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAF3IP3Q9Y228 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAF3IP3Q9Y228 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAF3IP3Q9Y228 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAF3IP3Q9Y228 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAF3IP3Q9Y228 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAF3IP3Q9Y228 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAF3IP3Q9Y228 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAF3IP3Q9Y228 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAF3IP3Q9Y228 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAF3IP3Q9Y228 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAF3IP3Q9Y228 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAF3IP3Q9Y228 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAF3IP3Q9Y228 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAF3IP3Q9Y228 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAF3IP3Q9Y228 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAF3IP3Q9Y228 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAF3IP3Q9Y228 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAF3IP3Q9Y228 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAF3IP3Q9Y228 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAF3IP3Q9Y228 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAF3IP3Q9Y228 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAF3IP3Q9Y228 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAF3IP3Q9Y228 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAF3IP3Q9Y228 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAF3IP3Q9Y228 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAF3IP3Q9Y228 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAF3IP3Q9Y228 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAF3IP3Q9Y228 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAF3IP3Q9Y228 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAF3IP3Q9Y228 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAF3IP3Q9Y228 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAF3IP3Q9Y228 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAF3IP3Q9Y228 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAF3IP3Q9Y228 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAF3IP3Q9Y228 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAF3IP3Q9Y228 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAF3IP3Q9Y228 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAF3IP3Q9Y228 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAF3IP3Q9Y228 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAF3IP3Q9Y228 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAF3IP3Q9Y228 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAF3IP3Q9Y228 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAF3IP3Q9Y228 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAF3IP3Q9Y228 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAF3IP3Q9Y228 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAF3IP3Q9Y228 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAF3IP3Q9Y228 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAF3IP3Q9Y228 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAF3IP3Q9Y228 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAF3IP3Q9Y228 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAF3IP3Q9Y228 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAF3IP3Q9Y228 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAF3IP3Q9Y228 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAF3IP3Q9Y228 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAF3IP3Q9Y228 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAF3IP3Q9Y228 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAF3IP3Q9Y228 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAF3IP3Q9Y228 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAF3IP3Q9Y228 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAF3IP3Q9Y228 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAF3IP3Q9Y228 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAF3IP3Q9Y228 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAF3IP3Q9Y228 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAF3IP3Q9Y228 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAF3IP3Q9Y228 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAF3IP3Q9Y228 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAF3IP3Q9Y228 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAF3IP3Q9Y228 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAF3IP3Q9Y228 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAF3IP3Q9Y228 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAF3IP3Q9Y228 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAF3IP3Q9Y228 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAF3IP3Q9Y228 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAF3IP3Q9Y228 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAF3IP3Q9Y228 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAF3IP3Q9Y228 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAF3IP3Q9Y228 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAF3IP3Q9Y228 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAF3IP3Q9Y228 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAF3IP3Q9Y228 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAF3IP3Q9Y228 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms