Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNRC6BQ9UPQ9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNRC6BQ9UPQ9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNRC6BQ9UPQ9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNRC6BQ9UPQ9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNRC6BQ9UPQ9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TNRC6BQ9UPQ9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNRC6BQ9UPQ9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNRC6BQ9UPQ9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNRC6BQ9UPQ9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNRC6BQ9UPQ9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNRC6BQ9UPQ9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNRC6BQ9UPQ9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNRC6BQ9UPQ9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNRC6BQ9UPQ9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TNRC6BQ9UPQ9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TNRC6BQ9UPQ9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNRC6BQ9UPQ9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNRC6BQ9UPQ9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNRC6BQ9UPQ9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNRC6BQ9UPQ9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNRC6BQ9UPQ9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNRC6BQ9UPQ9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNRC6BQ9UPQ9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNRC6BQ9UPQ9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNRC6BQ9UPQ9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNRC6BQ9UPQ9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNRC6BQ9UPQ9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNRC6BQ9UPQ9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNRC6BQ9UPQ9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNRC6BQ9UPQ9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNRC6BQ9UPQ9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNRC6BQ9UPQ9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNRC6BQ9UPQ9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNRC6BQ9UPQ9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNRC6BQ9UPQ9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNRC6BQ9UPQ9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNRC6BQ9UPQ9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNRC6BQ9UPQ9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNRC6BQ9UPQ9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TNRC6BQ9UPQ9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNRC6BQ9UPQ9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNRC6BQ9UPQ9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNRC6BQ9UPQ9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNRC6BQ9UPQ9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNRC6BQ9UPQ9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNRC6BQ9UPQ9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNRC6BQ9UPQ9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNRC6BQ9UPQ9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNRC6BQ9UPQ9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNRC6BQ9UPQ9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNRC6BQ9UPQ9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNRC6BQ9UPQ9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TNRC6BQ9UPQ9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNRC6BQ9UPQ9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNRC6BQ9UPQ9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TNRC6BQ9UPQ9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNRC6BQ9UPQ9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TNRC6BQ9UPQ9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNRC6BQ9UPQ9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNRC6BQ9UPQ9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNRC6BQ9UPQ9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TNRC6BQ9UPQ9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNRC6BQ9UPQ9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNRC6BQ9UPQ9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TNRC6BQ9UPQ9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TNRC6BQ9UPQ9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TNRC6BQ9UPQ9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNRC6BQ9UPQ9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNRC6BQ9UPQ9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNRC6BQ9UPQ9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNRC6BQ9UPQ9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNRC6BQ9UPQ9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNRC6BQ9UPQ9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNRC6BQ9UPQ9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNRC6BQ9UPQ9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNRC6BQ9UPQ9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNRC6BQ9UPQ9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNRC6BQ9UPQ9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNRC6BQ9UPQ9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNRC6BQ9UPQ9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNRC6BQ9UPQ9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNRC6BQ9UPQ9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNRC6BQ9UPQ9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNRC6BQ9UPQ9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNRC6BQ9UPQ9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNRC6BQ9UPQ9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TNRC6BQ9UPQ9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TNRC6BQ9UPQ9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TNRC6BQ9UPQ9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNRC6BQ9UPQ9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNRC6BQ9UPQ9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNRC6BQ9UPQ9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNRC6BQ9UPQ9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNRC6BQ9UPQ9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TNRC6BQ9UPQ9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TNRC6BQ9UPQ9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNRC6BQ9UPQ9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms