Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPE1

SRPK3, SRSF protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK3Q9UPE1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRPK3Q9UPE1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRPK3Q9UPE1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRPK3Q9UPE1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRPK3Q9UPE1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRPK3Q9UPE1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRPK3Q9UPE1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRPK3Q9UPE1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRPK3Q9UPE1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRPK3Q9UPE1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SRPK3Q9UPE1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRPK3Q9UPE1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRPK3Q9UPE1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRPK3Q9UPE1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRPK3Q9UPE1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRPK3Q9UPE1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRPK3Q9UPE1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRPK3Q9UPE1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRPK3Q9UPE1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRPK3Q9UPE1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRPK3Q9UPE1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRPK3Q9UPE1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRPK3Q9UPE1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SRPK3Q9UPE1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SRPK3Q9UPE1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRPK3Q9UPE1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRPK3Q9UPE1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRPK3Q9UPE1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRPK3Q9UPE1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRPK3Q9UPE1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRPK3Q9UPE1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SRPK3Q9UPE1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRPK3Q9UPE1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRPK3Q9UPE1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRPK3Q9UPE1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRPK3Q9UPE1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRPK3Q9UPE1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRPK3Q9UPE1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRPK3Q9UPE1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRPK3Q9UPE1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRPK3Q9UPE1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRPK3Q9UPE1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRPK3Q9UPE1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRPK3Q9UPE1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPK3Q9UPE1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPK3Q9UPE1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPK3Q9UPE1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPK3Q9UPE1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPK3Q9UPE1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPK3Q9UPE1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPK3Q9UPE1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRPK3Q9UPE1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRPK3Q9UPE1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRPK3Q9UPE1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRPK3Q9UPE1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRPK3Q9UPE1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRPK3Q9UPE1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRPK3Q9UPE1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SRPK3Q9UPE1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRPK3Q9UPE1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRPK3Q9UPE1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRPK3Q9UPE1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRPK3Q9UPE1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRPK3Q9UPE1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SRPK3Q9UPE1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRPK3Q9UPE1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRPK3Q9UPE1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SRPK3Q9UPE1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRPK3Q9UPE1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SRPK3Q9UPE1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRPK3Q9UPE1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRPK3Q9UPE1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRPK3Q9UPE1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRPK3Q9UPE1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SRPK3Q9UPE1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRPK3Q9UPE1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRPK3Q9UPE1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRPK3Q9UPE1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRPK3Q9UPE1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRPK3Q9UPE1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRPK3Q9UPE1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRPK3Q9UPE1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRPK3Q9UPE1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRPK3Q9UPE1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRPK3Q9UPE1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRPK3Q9UPE1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRPK3Q9UPE1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRPK3Q9UPE1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRPK3Q9UPE1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SRPK3Q9UPE1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRPK3Q9UPE1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SRPK3Q9UPE1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRPK3Q9UPE1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SRPK3Q9UPE1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRPK3Q9UPE1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRPK3Q9UPE1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRPK3Q9UPE1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRPK3Q9UPE1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRPK3Q9UPE1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRPK3Q9UPE1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms