Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS3Q9UNS2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS3Q9UNS2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS3Q9UNS2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS3Q9UNS2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS3Q9UNS2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS3Q9UNS2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS3Q9UNS2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS3Q9UNS2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS3Q9UNS2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS3Q9UNS2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPS3Q9UNS2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPS3Q9UNS2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPS3Q9UNS2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPS3Q9UNS2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPS3Q9UNS2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPS3Q9UNS2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPS3Q9UNS2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPS3Q9UNS2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPS3Q9UNS2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPS3Q9UNS2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPS3Q9UNS2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPS3Q9UNS2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPS3Q9UNS2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPS3Q9UNS2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPS3Q9UNS2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPS3Q9UNS2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
COPS3Q9UNS2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPS3Q9UNS2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPS3Q9UNS2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPS3Q9UNS2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPS3Q9UNS2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPS3Q9UNS2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPS3Q9UNS2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPS3Q9UNS2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPS3Q9UNS2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
COPS3Q9UNS2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPS3Q9UNS2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPS3Q9UNS2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPS3Q9UNS2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
COPS3Q9UNS2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COPS3Q9UNS2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPS3Q9UNS2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPS3Q9UNS2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPS3Q9UNS2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPS3Q9UNS2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPS3Q9UNS2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPS3Q9UNS2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPS3Q9UNS2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPS3Q9UNS2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPS3Q9UNS2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COPS3Q9UNS2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPS3Q9UNS2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COPS3Q9UNS2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COPS3Q9UNS2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS3Q9UNS2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS3Q9UNS2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS3Q9UNS2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS3Q9UNS2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS3Q9UNS2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS3Q9UNS2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS3Q9UNS2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS3Q9UNS2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS3Q9UNS2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS3Q9UNS2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS3Q9UNS2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS3Q9UNS2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS3Q9UNS2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS3Q9UNS2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS3Q9UNS2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS3Q9UNS2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS3Q9UNS2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS3Q9UNS2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS3Q9UNS2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS3Q9UNS2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS3Q9UNS2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS3Q9UNS2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS3Q9UNS2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS3Q9UNS2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
COPS3Q9UNS2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPS3Q9UNS2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS3Q9UNS2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS3Q9UNS2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS3Q9UNS2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS3Q9UNS2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS3Q9UNS2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS3Q9UNS2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS3Q9UNS2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPS3Q9UNS2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPS3Q9UNS2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPS3Q9UNS2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPS3Q9UNS2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPS3Q9UNS2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPS3Q9UNS2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPS3Q9UNS2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPS3Q9UNS2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPS3Q9UNS2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPS3Q9UNS2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPS3Q9UNS2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPS3Q9UNS2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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