Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM21

MGAT4A, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase A, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT4AQ9UM21 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MGAT4AQ9UM21 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MGAT4AQ9UM21 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MGAT4AQ9UM21 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MGAT4AQ9UM21 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MGAT4AQ9UM21 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MGAT4AQ9UM21 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MGAT4AQ9UM21 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MGAT4AQ9UM21 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MGAT4AQ9UM21 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MGAT4AQ9UM21 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGAT4AQ9UM21 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGAT4AQ9UM21 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGAT4AQ9UM21 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGAT4AQ9UM21 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGAT4AQ9UM21 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGAT4AQ9UM21 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MGAT4AQ9UM21 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MGAT4AQ9UM21 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MGAT4AQ9UM21 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MGAT4AQ9UM21 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MGAT4AQ9UM21 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MGAT4AQ9UM21 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MGAT4AQ9UM21 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MGAT4AQ9UM21 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MGAT4AQ9UM21 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MGAT4AQ9UM21 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MGAT4AQ9UM21 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MGAT4AQ9UM21 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MGAT4AQ9UM21 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MGAT4AQ9UM21 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MGAT4AQ9UM21 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MGAT4AQ9UM21 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MGAT4AQ9UM21 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MGAT4AQ9UM21 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MGAT4AQ9UM21 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MGAT4AQ9UM21 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MGAT4AQ9UM21 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MGAT4AQ9UM21 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MGAT4AQ9UM21 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MGAT4AQ9UM21 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MGAT4AQ9UM21 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MGAT4AQ9UM21 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MGAT4AQ9UM21 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MGAT4AQ9UM21 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MGAT4AQ9UM21 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MGAT4AQ9UM21 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MGAT4AQ9UM21 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MGAT4AQ9UM21 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MGAT4AQ9UM21 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MGAT4AQ9UM21 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MGAT4AQ9UM21 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MGAT4AQ9UM21 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MGAT4AQ9UM21 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MGAT4AQ9UM21 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MGAT4AQ9UM21 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MGAT4AQ9UM21 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MGAT4AQ9UM21 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MGAT4AQ9UM21 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MGAT4AQ9UM21 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MGAT4AQ9UM21 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MGAT4AQ9UM21 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MGAT4AQ9UM21 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MGAT4AQ9UM21 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MGAT4AQ9UM21 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MGAT4AQ9UM21 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MGAT4AQ9UM21 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MGAT4AQ9UM21 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MGAT4AQ9UM21 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MGAT4AQ9UM21 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MGAT4AQ9UM21 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MGAT4AQ9UM21 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MGAT4AQ9UM21 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
MGAT4AQ9UM21 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MGAT4AQ9UM21 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MGAT4AQ9UM21 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MGAT4AQ9UM21 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MGAT4AQ9UM21 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MGAT4AQ9UM21 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MGAT4AQ9UM21 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MGAT4AQ9UM21 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MGAT4AQ9UM21 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MGAT4AQ9UM21 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MGAT4AQ9UM21 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MGAT4AQ9UM21 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MGAT4AQ9UM21 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MGAT4AQ9UM21 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
MGAT4AQ9UM21 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
MGAT4AQ9UM21 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MGAT4AQ9UM21 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MGAT4AQ9UM21 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MGAT4AQ9UM21 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MGAT4AQ9UM21 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MGAT4AQ9UM21 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MGAT4AQ9UM21 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MGAT4AQ9UM21 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MGAT4AQ9UM21 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MGAT4AQ9UM21 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MGAT4AQ9UM21 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MGAT4AQ9UM21 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.7 ms