Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ZNRF3Q9ULT6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ZNRF3Q9ULT6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
ZNRF3Q9ULT6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ZNRF3Q9ULT6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ZNRF3Q9ULT6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ZNRF3Q9ULT6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ZNRF3Q9ULT6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ZNRF3Q9ULT6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ZNRF3Q9ULT6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
ZNRF3Q9ULT6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ZNRF3Q9ULT6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ZNRF3Q9ULT6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ZNRF3Q9ULT6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ZNRF3Q9ULT6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ZNRF3Q9ULT6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ZNRF3Q9ULT6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ZNRF3Q9ULT6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
ZNRF3Q9ULT6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
ZNRF3Q9ULT6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
ZNRF3Q9ULT6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ZNRF3Q9ULT6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
ZNRF3Q9ULT6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ZNRF3Q9ULT6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ZNRF3Q9ULT6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ZNRF3Q9ULT6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ZNRF3Q9ULT6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ZNRF3Q9ULT6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ZNRF3Q9ULT6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ZNRF3Q9ULT6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
ZNRF3Q9ULT6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ZNRF3Q9ULT6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
ZNRF3Q9ULT6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ZNRF3Q9ULT6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ZNRF3Q9ULT6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
ZNRF3Q9ULT6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ZNRF3Q9ULT6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ZNRF3Q9ULT6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ZNRF3Q9ULT6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ZNRF3Q9ULT6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ZNRF3Q9ULT6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ZNRF3Q9ULT6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ZNRF3Q9ULT6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ZNRF3Q9ULT6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ZNRF3Q9ULT6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ZNRF3Q9ULT6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ZNRF3Q9ULT6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ZNRF3Q9ULT6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ZNRF3Q9ULT6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ZNRF3Q9ULT6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ZNRF3Q9ULT6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ZNRF3Q9ULT6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ZNRF3Q9ULT6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ZNRF3Q9ULT6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ZNRF3Q9ULT6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ZNRF3Q9ULT6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ZNRF3Q9ULT6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ZNRF3Q9ULT6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ZNRF3Q9ULT6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ZNRF3Q9ULT6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ZNRF3Q9ULT6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ZNRF3Q9ULT6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
ZNRF3Q9ULT6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ZNRF3Q9ULT6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ZNRF3Q9ULT6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ZNRF3Q9ULT6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ZNRF3Q9ULT6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ZNRF3Q9ULT6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ZNRF3Q9ULT6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ZNRF3Q9ULT6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ZNRF3Q9ULT6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ZNRF3Q9ULT6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
ZNRF3Q9ULT6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ZNRF3Q9ULT6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ZNRF3Q9ULT6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ZNRF3Q9ULT6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ZNRF3Q9ULT6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
ZNRF3Q9ULT6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
ZNRF3Q9ULT6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
ZNRF3Q9ULT6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ZNRF3Q9ULT6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ZNRF3Q9ULT6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ZNRF3Q9ULT6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ZNRF3Q9ULT6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
ZNRF3Q9ULT6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ZNRF3Q9ULT6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ZNRF3Q9ULT6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ZNRF3Q9ULT6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
ZNRF3Q9ULT6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ZNRF3Q9ULT6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ZNRF3Q9ULT6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ZNRF3Q9ULT6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ZNRF3Q9ULT6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ZNRF3Q9ULT6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ZNRF3Q9ULT6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ZNRF3Q9ULT6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ZNRF3Q9ULT6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
ZNRF3Q9ULT6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ZNRF3Q9ULT6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1842.3 ms