Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCTN4Q9UJW0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCTN4Q9UJW0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCTN4Q9UJW0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCTN4Q9UJW0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCTN4Q9UJW0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCTN4Q9UJW0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCTN4Q9UJW0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCTN4Q9UJW0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCTN4Q9UJW0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCTN4Q9UJW0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCTN4Q9UJW0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCTN4Q9UJW0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCTN4Q9UJW0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCTN4Q9UJW0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCTN4Q9UJW0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCTN4Q9UJW0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCTN4Q9UJW0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCTN4Q9UJW0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCTN4Q9UJW0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCTN4Q9UJW0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCTN4Q9UJW0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCTN4Q9UJW0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCTN4Q9UJW0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCTN4Q9UJW0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCTN4Q9UJW0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DCTN4Q9UJW0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCTN4Q9UJW0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCTN4Q9UJW0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCTN4Q9UJW0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCTN4Q9UJW0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCTN4Q9UJW0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCTN4Q9UJW0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCTN4Q9UJW0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCTN4Q9UJW0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCTN4Q9UJW0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCTN4Q9UJW0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DCTN4Q9UJW0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCTN4Q9UJW0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCTN4Q9UJW0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCTN4Q9UJW0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCTN4Q9UJW0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCTN4Q9UJW0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCTN4Q9UJW0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCTN4Q9UJW0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCTN4Q9UJW0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCTN4Q9UJW0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCTN4Q9UJW0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DCTN4Q9UJW0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCTN4Q9UJW0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCTN4Q9UJW0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCTN4Q9UJW0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DCTN4Q9UJW0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCTN4Q9UJW0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCTN4Q9UJW0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCTN4Q9UJW0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DCTN4Q9UJW0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCTN4Q9UJW0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCTN4Q9UJW0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCTN4Q9UJW0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCTN4Q9UJW0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCTN4Q9UJW0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCTN4Q9UJW0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DCTN4Q9UJW0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DCTN4Q9UJW0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DCTN4Q9UJW0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCTN4Q9UJW0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCTN4Q9UJW0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCTN4Q9UJW0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCTN4Q9UJW0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCTN4Q9UJW0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCTN4Q9UJW0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DCTN4Q9UJW0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCTN4Q9UJW0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCTN4Q9UJW0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCTN4Q9UJW0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCTN4Q9UJW0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCTN4Q9UJW0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DCTN4Q9UJW0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCTN4Q9UJW0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCTN4Q9UJW0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCTN4Q9UJW0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCTN4Q9UJW0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCTN4Q9UJW0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCTN4Q9UJW0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCTN4Q9UJW0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCTN4Q9UJW0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCTN4Q9UJW0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCTN4Q9UJW0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCTN4Q9UJW0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCTN4Q9UJW0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCTN4Q9UJW0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCTN4Q9UJW0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DCTN4Q9UJW0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCTN4Q9UJW0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCTN4Q9UJW0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCTN4Q9UJW0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DCTN4Q9UJW0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCTN4Q9UJW0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCTN4Q9UJW0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms