Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIMS3Q9UJD0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIMS3Q9UJD0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIMS3Q9UJD0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIMS3Q9UJD0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RIMS3Q9UJD0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIMS3Q9UJD0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RIMS3Q9UJD0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RIMS3Q9UJD0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIMS3Q9UJD0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIMS3Q9UJD0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIMS3Q9UJD0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIMS3Q9UJD0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIMS3Q9UJD0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIMS3Q9UJD0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIMS3Q9UJD0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIMS3Q9UJD0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIMS3Q9UJD0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIMS3Q9UJD0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIMS3Q9UJD0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIMS3Q9UJD0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIMS3Q9UJD0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIMS3Q9UJD0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIMS3Q9UJD0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIMS3Q9UJD0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIMS3Q9UJD0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIMS3Q9UJD0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIMS3Q9UJD0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIMS3Q9UJD0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIMS3Q9UJD0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIMS3Q9UJD0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIMS3Q9UJD0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIMS3Q9UJD0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIMS3Q9UJD0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RIMS3Q9UJD0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIMS3Q9UJD0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RIMS3Q9UJD0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIMS3Q9UJD0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIMS3Q9UJD0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIMS3Q9UJD0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIMS3Q9UJD0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIMS3Q9UJD0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIMS3Q9UJD0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIMS3Q9UJD0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIMS3Q9UJD0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIMS3Q9UJD0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIMS3Q9UJD0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIMS3Q9UJD0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIMS3Q9UJD0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIMS3Q9UJD0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIMS3Q9UJD0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIMS3Q9UJD0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIMS3Q9UJD0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIMS3Q9UJD0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIMS3Q9UJD0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIMS3Q9UJD0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIMS3Q9UJD0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIMS3Q9UJD0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIMS3Q9UJD0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIMS3Q9UJD0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIMS3Q9UJD0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIMS3Q9UJD0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIMS3Q9UJD0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIMS3Q9UJD0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIMS3Q9UJD0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIMS3Q9UJD0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIMS3Q9UJD0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIMS3Q9UJD0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIMS3Q9UJD0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RIMS3Q9UJD0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RIMS3Q9UJD0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RIMS3Q9UJD0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RIMS3Q9UJD0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMS3Q9UJD0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMS3Q9UJD0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMS3Q9UJD0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMS3Q9UJD0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMS3Q9UJD0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMS3Q9UJD0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMS3Q9UJD0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMS3Q9UJD0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMS3Q9UJD0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMS3Q9UJD0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMS3Q9UJD0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMS3Q9UJD0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMS3Q9UJD0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMS3Q9UJD0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMS3Q9UJD0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMS3Q9UJD0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMS3Q9UJD0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMS3Q9UJD0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMS3Q9UJD0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMS3Q9UJD0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMS3Q9UJD0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMS3Q9UJD0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMS3Q9UJD0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMS3Q9UJD0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMS3Q9UJD0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMS3Q9UJD0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMS3Q9UJD0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms