Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms