Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FBXO40Q9UH90 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
FBXO40Q9UH90 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
FBXO40Q9UH90 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FBXO40Q9UH90 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FBXO40Q9UH90 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FBXO40Q9UH90 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FBXO40Q9UH90 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FBXO40Q9UH90 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FBXO40Q9UH90 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FBXO40Q9UH90 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FBXO40Q9UH90 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FBXO40Q9UH90 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FBXO40Q9UH90 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FBXO40Q9UH90 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FBXO40Q9UH90 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FBXO40Q9UH90 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FBXO40Q9UH90 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FBXO40Q9UH90 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FBXO40Q9UH90 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FBXO40Q9UH90 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FBXO40Q9UH90 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FBXO40Q9UH90 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FBXO40Q9UH90 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FBXO40Q9UH90 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FBXO40Q9UH90 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
FBXO40Q9UH90 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FBXO40Q9UH90 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FBXO40Q9UH90 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FBXO40Q9UH90 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FBXO40Q9UH90 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FBXO40Q9UH90 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FBXO40Q9UH90 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FBXO40Q9UH90 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FBXO40Q9UH90 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FBXO40Q9UH90 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
FBXO40Q9UH90 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FBXO40Q9UH90 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
FBXO40Q9UH90 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FBXO40Q9UH90 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FBXO40Q9UH90 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FBXO40Q9UH90 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FBXO40Q9UH90 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FBXO40Q9UH90 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FBXO40Q9UH90 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FBXO40Q9UH90 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FBXO40Q9UH90 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FBXO40Q9UH90 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FBXO40Q9UH90 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FBXO40Q9UH90 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FBXO40Q9UH90 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FBXO40Q9UH90 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FBXO40Q9UH90 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
FBXO40Q9UH90 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
FBXO40Q9UH90 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FBXO40Q9UH90 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FBXO40Q9UH90 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FBXO40Q9UH90 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FBXO40Q9UH90 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
FBXO40Q9UH90 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FBXO40Q9UH90 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FBXO40Q9UH90 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FBXO40Q9UH90 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
FBXO40Q9UH90 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FBXO40Q9UH90 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FBXO40Q9UH90 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FBXO40Q9UH90 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FBXO40Q9UH90 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FBXO40Q9UH90 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
FBXO40Q9UH90 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FBXO40Q9UH90 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FBXO40Q9UH90 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FBXO40Q9UH90 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FBXO40Q9UH90 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FBXO40Q9UH90 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FBXO40Q9UH90 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FBXO40Q9UH90 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FBXO40Q9UH90 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FBXO40Q9UH90 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FBXO40Q9UH90 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FBXO40Q9UH90 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FBXO40Q9UH90 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FBXO40Q9UH90 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FBXO40Q9UH90 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FBXO40Q9UH90 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FBXO40Q9UH90 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FBXO40Q9UH90 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FBXO40Q9UH90 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
FBXO40Q9UH90 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
FBXO40Q9UH90 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FBXO40Q9UH90 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FBXO40Q9UH90 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FBXO40Q9UH90 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FBXO40Q9UH90 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FBXO40Q9UH90 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FBXO40Q9UH90 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FBXO40Q9UH90 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FBXO40Q9UH90 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FBXO40Q9UH90 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FBXO40Q9UH90 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms