Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH65

SWAP70, Switch-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWAP70Q9UH65 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SWAP70Q9UH65 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SWAP70Q9UH65 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SWAP70Q9UH65 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SWAP70Q9UH65 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SWAP70Q9UH65 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SWAP70Q9UH65 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SWAP70Q9UH65 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SWAP70Q9UH65 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SWAP70Q9UH65 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SWAP70Q9UH65 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SWAP70Q9UH65 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SWAP70Q9UH65 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SWAP70Q9UH65 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SWAP70Q9UH65 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SWAP70Q9UH65 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SWAP70Q9UH65 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SWAP70Q9UH65 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SWAP70Q9UH65 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SWAP70Q9UH65 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SWAP70Q9UH65 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SWAP70Q9UH65 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SWAP70Q9UH65 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SWAP70Q9UH65 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SWAP70Q9UH65 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SWAP70Q9UH65 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SWAP70Q9UH65 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SWAP70Q9UH65 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SWAP70Q9UH65 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SWAP70Q9UH65 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SWAP70Q9UH65 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SWAP70Q9UH65 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SWAP70Q9UH65 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SWAP70Q9UH65 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SWAP70Q9UH65 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SWAP70Q9UH65 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SWAP70Q9UH65 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SWAP70Q9UH65 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SWAP70Q9UH65 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SWAP70Q9UH65 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SWAP70Q9UH65 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SWAP70Q9UH65 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SWAP70Q9UH65 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SWAP70Q9UH65 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SWAP70Q9UH65 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SWAP70Q9UH65 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SWAP70Q9UH65 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SWAP70Q9UH65 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SWAP70Q9UH65 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SWAP70Q9UH65 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SWAP70Q9UH65 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SWAP70Q9UH65 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SWAP70Q9UH65 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SWAP70Q9UH65 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SWAP70Q9UH65 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SWAP70Q9UH65 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SWAP70Q9UH65 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SWAP70Q9UH65 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SWAP70Q9UH65 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SWAP70Q9UH65 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SWAP70Q9UH65 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SWAP70Q9UH65 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SWAP70Q9UH65 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SWAP70Q9UH65 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SWAP70Q9UH65 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SWAP70Q9UH65 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SWAP70Q9UH65 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SWAP70Q9UH65 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SWAP70Q9UH65 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SWAP70Q9UH65 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SWAP70Q9UH65 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SWAP70Q9UH65 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SWAP70Q9UH65 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SWAP70Q9UH65 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SWAP70Q9UH65 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SWAP70Q9UH65 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SWAP70Q9UH65 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SWAP70Q9UH65 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SWAP70Q9UH65 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SWAP70Q9UH65 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SWAP70Q9UH65 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SWAP70Q9UH65 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SWAP70Q9UH65 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SWAP70Q9UH65 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SWAP70Q9UH65 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SWAP70Q9UH65 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SWAP70Q9UH65 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SWAP70Q9UH65 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SWAP70Q9UH65 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SWAP70Q9UH65 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SWAP70Q9UH65 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SWAP70Q9UH65 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SWAP70Q9UH65 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SWAP70Q9UH65 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SWAP70Q9UH65 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SWAP70Q9UH65 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SWAP70Q9UH65 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SWAP70Q9UH65 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SWAP70Q9UH65 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SWAP70Q9UH65 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms