Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGV2

NDRG3, Protein NDRG3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG3Q9UGV2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDRG3Q9UGV2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NDRG3Q9UGV2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDRG3Q9UGV2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDRG3Q9UGV2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDRG3Q9UGV2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDRG3Q9UGV2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDRG3Q9UGV2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDRG3Q9UGV2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDRG3Q9UGV2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDRG3Q9UGV2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDRG3Q9UGV2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDRG3Q9UGV2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDRG3Q9UGV2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDRG3Q9UGV2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NDRG3Q9UGV2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDRG3Q9UGV2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDRG3Q9UGV2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDRG3Q9UGV2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDRG3Q9UGV2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NDRG3Q9UGV2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDRG3Q9UGV2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDRG3Q9UGV2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDRG3Q9UGV2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDRG3Q9UGV2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDRG3Q9UGV2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDRG3Q9UGV2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NDRG3Q9UGV2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDRG3Q9UGV2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDRG3Q9UGV2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDRG3Q9UGV2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDRG3Q9UGV2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
NDRG3Q9UGV2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDRG3Q9UGV2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDRG3Q9UGV2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDRG3Q9UGV2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDRG3Q9UGV2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDRG3Q9UGV2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDRG3Q9UGV2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDRG3Q9UGV2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDRG3Q9UGV2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDRG3Q9UGV2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDRG3Q9UGV2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDRG3Q9UGV2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDRG3Q9UGV2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDRG3Q9UGV2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDRG3Q9UGV2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDRG3Q9UGV2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDRG3Q9UGV2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDRG3Q9UGV2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDRG3Q9UGV2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDRG3Q9UGV2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDRG3Q9UGV2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDRG3Q9UGV2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDRG3Q9UGV2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDRG3Q9UGV2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDRG3Q9UGV2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NDRG3Q9UGV2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NDRG3Q9UGV2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDRG3Q9UGV2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDRG3Q9UGV2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDRG3Q9UGV2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDRG3Q9UGV2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDRG3Q9UGV2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDRG3Q9UGV2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDRG3Q9UGV2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NDRG3Q9UGV2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDRG3Q9UGV2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NDRG3Q9UGV2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NDRG3Q9UGV2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NDRG3Q9UGV2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NDRG3Q9UGV2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NDRG3Q9UGV2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NDRG3Q9UGV2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDRG3Q9UGV2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDRG3Q9UGV2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDRG3Q9UGV2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDRG3Q9UGV2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDRG3Q9UGV2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDRG3Q9UGV2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDRG3Q9UGV2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDRG3Q9UGV2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDRG3Q9UGV2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDRG3Q9UGV2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NDRG3Q9UGV2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDRG3Q9UGV2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDRG3Q9UGV2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NDRG3Q9UGV2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDRG3Q9UGV2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDRG3Q9UGV2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDRG3Q9UGV2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDRG3Q9UGV2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDRG3Q9UGV2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDRG3Q9UGV2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDRG3Q9UGV2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDRG3Q9UGV2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NDRG3Q9UGV2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDRG3Q9UGV2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NDRG3Q9UGV2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDRG3Q9UGV2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms