Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VTI1BQ9UEU0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VTI1BQ9UEU0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
VTI1BQ9UEU0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
VTI1BQ9UEU0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VTI1BQ9UEU0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VTI1BQ9UEU0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VTI1BQ9UEU0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VTI1BQ9UEU0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VTI1BQ9UEU0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VTI1BQ9UEU0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VTI1BQ9UEU0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VTI1BQ9UEU0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
VTI1BQ9UEU0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VTI1BQ9UEU0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VTI1BQ9UEU0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VTI1BQ9UEU0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VTI1BQ9UEU0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VTI1BQ9UEU0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VTI1BQ9UEU0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VTI1BQ9UEU0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VTI1BQ9UEU0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VTI1BQ9UEU0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VTI1BQ9UEU0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VTI1BQ9UEU0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VTI1BQ9UEU0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VTI1BQ9UEU0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VTI1BQ9UEU0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VTI1BQ9UEU0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VTI1BQ9UEU0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VTI1BQ9UEU0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VTI1BQ9UEU0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VTI1BQ9UEU0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VTI1BQ9UEU0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VTI1BQ9UEU0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VTI1BQ9UEU0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VTI1BQ9UEU0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VTI1BQ9UEU0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VTI1BQ9UEU0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VTI1BQ9UEU0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VTI1BQ9UEU0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VTI1BQ9UEU0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VTI1BQ9UEU0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VTI1BQ9UEU0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VTI1BQ9UEU0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VTI1BQ9UEU0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VTI1BQ9UEU0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VTI1BQ9UEU0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VTI1BQ9UEU0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VTI1BQ9UEU0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VTI1BQ9UEU0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VTI1BQ9UEU0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VTI1BQ9UEU0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VTI1BQ9UEU0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VTI1BQ9UEU0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VTI1BQ9UEU0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VTI1BQ9UEU0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VTI1BQ9UEU0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
VTI1BQ9UEU0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VTI1BQ9UEU0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VTI1BQ9UEU0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VTI1BQ9UEU0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VTI1BQ9UEU0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VTI1BQ9UEU0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VTI1BQ9UEU0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VTI1BQ9UEU0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VTI1BQ9UEU0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VTI1BQ9UEU0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VTI1BQ9UEU0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VTI1BQ9UEU0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VTI1BQ9UEU0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VTI1BQ9UEU0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VTI1BQ9UEU0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
VTI1BQ9UEU0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
VTI1BQ9UEU0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VTI1BQ9UEU0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VTI1BQ9UEU0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VTI1BQ9UEU0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VTI1BQ9UEU0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VTI1BQ9UEU0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VTI1BQ9UEU0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VTI1BQ9UEU0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VTI1BQ9UEU0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VTI1BQ9UEU0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VTI1BQ9UEU0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VTI1BQ9UEU0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VTI1BQ9UEU0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VTI1BQ9UEU0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VTI1BQ9UEU0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VTI1BQ9UEU0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VTI1BQ9UEU0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VTI1BQ9UEU0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VTI1BQ9UEU0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VTI1BQ9UEU0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VTI1BQ9UEU0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VTI1BQ9UEU0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VTI1BQ9UEU0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VTI1BQ9UEU0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VTI1BQ9UEU0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VTI1BQ9UEU0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms