Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
POLKQ9UBT6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
POLKQ9UBT6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
POLKQ9UBT6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■■□ 3
POLKQ9UBT6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
POLKQ9UBT6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
POLKQ9UBT6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
POLKQ9UBT6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
POLKQ9UBT6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
POLKQ9UBT6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
POLKQ9UBT6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
POLKQ9UBT6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
POLKQ9UBT6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
POLKQ9UBT6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
POLKQ9UBT6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
POLKQ9UBT6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
POLKQ9UBT6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
POLKQ9UBT6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
POLKQ9UBT6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
POLKQ9UBT6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
POLKQ9UBT6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
POLKQ9UBT6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
POLKQ9UBT6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
POLKQ9UBT6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
POLKQ9UBT6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
POLKQ9UBT6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
POLKQ9UBT6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
POLKQ9UBT6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
POLKQ9UBT6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
POLKQ9UBT6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
POLKQ9UBT6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
POLKQ9UBT6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
POLKQ9UBT6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
POLKQ9UBT6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
POLKQ9UBT6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
POLKQ9UBT6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
POLKQ9UBT6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
POLKQ9UBT6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
POLKQ9UBT6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
POLKQ9UBT6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
POLKQ9UBT6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
POLKQ9UBT6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
POLKQ9UBT6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
POLKQ9UBT6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
POLKQ9UBT6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
POLKQ9UBT6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
POLKQ9UBT6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
POLKQ9UBT6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
POLKQ9UBT6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
POLKQ9UBT6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
POLKQ9UBT6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
POLKQ9UBT6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
POLKQ9UBT6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
POLKQ9UBT6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
POLKQ9UBT6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
POLKQ9UBT6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
POLKQ9UBT6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
POLKQ9UBT6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
POLKQ9UBT6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
POLKQ9UBT6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
POLKQ9UBT6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
POLKQ9UBT6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
POLKQ9UBT6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
POLKQ9UBT6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
POLKQ9UBT6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
POLKQ9UBT6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
POLKQ9UBT6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
POLKQ9UBT6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
POLKQ9UBT6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
POLKQ9UBT6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
POLKQ9UBT6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
POLKQ9UBT6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
POLKQ9UBT6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
POLKQ9UBT6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
POLKQ9UBT6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
POLKQ9UBT6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
POLKQ9UBT6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
POLKQ9UBT6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC33.56■■■□□ 2.96
POLKQ9UBT6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
POLKQ9UBT6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
POLKQ9UBT6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
POLKQ9UBT6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
POLKQ9UBT6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
POLKQ9UBT6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
POLKQ9UBT6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
POLKQ9UBT6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
POLKQ9UBT6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
POLKQ9UBT6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
POLKQ9UBT6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
POLKQ9UBT6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
POLKQ9UBT6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
POLKQ9UBT6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
POLKQ9UBT6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
POLKQ9UBT6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
POLKQ9UBT6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
POLKQ9UBT6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
POLKQ9UBT6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
POLKQ9UBT6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
POLKQ9UBT6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
POLKQ9UBT6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms