Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRPC4Q9UBN4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPC4Q9UBN4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPC4Q9UBN4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPC4Q9UBN4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPC4Q9UBN4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPC4Q9UBN4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRPC4Q9UBN4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRPC4Q9UBN4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRPC4Q9UBN4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRPC4Q9UBN4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRPC4Q9UBN4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRPC4Q9UBN4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRPC4Q9UBN4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPC4Q9UBN4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPC4Q9UBN4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPC4Q9UBN4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPC4Q9UBN4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPC4Q9UBN4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPC4Q9UBN4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPC4Q9UBN4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRPC4Q9UBN4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRPC4Q9UBN4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRPC4Q9UBN4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRPC4Q9UBN4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRPC4Q9UBN4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRPC4Q9UBN4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRPC4Q9UBN4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRPC4Q9UBN4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRPC4Q9UBN4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRPC4Q9UBN4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRPC4Q9UBN4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRPC4Q9UBN4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRPC4Q9UBN4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TRPC4Q9UBN4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRPC4Q9UBN4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRPC4Q9UBN4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRPC4Q9UBN4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRPC4Q9UBN4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TRPC4Q9UBN4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRPC4Q9UBN4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TRPC4Q9UBN4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRPC4Q9UBN4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRPC4Q9UBN4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRPC4Q9UBN4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRPC4Q9UBN4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRPC4Q9UBN4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRPC4Q9UBN4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRPC4Q9UBN4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRPC4Q9UBN4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRPC4Q9UBN4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRPC4Q9UBN4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRPC4Q9UBN4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRPC4Q9UBN4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRPC4Q9UBN4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRPC4Q9UBN4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRPC4Q9UBN4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRPC4Q9UBN4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRPC4Q9UBN4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TRPC4Q9UBN4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRPC4Q9UBN4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRPC4Q9UBN4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRPC4Q9UBN4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRPC4Q9UBN4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRPC4Q9UBN4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRPC4Q9UBN4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRPC4Q9UBN4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRPC4Q9UBN4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRPC4Q9UBN4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRPC4Q9UBN4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRPC4Q9UBN4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRPC4Q9UBN4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRPC4Q9UBN4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRPC4Q9UBN4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRPC4Q9UBN4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRPC4Q9UBN4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRPC4Q9UBN4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRPC4Q9UBN4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRPC4Q9UBN4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRPC4Q9UBN4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRPC4Q9UBN4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRPC4Q9UBN4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRPC4Q9UBN4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRPC4Q9UBN4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRPC4Q9UBN4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRPC4Q9UBN4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRPC4Q9UBN4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRPC4Q9UBN4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRPC4Q9UBN4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRPC4Q9UBN4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRPC4Q9UBN4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRPC4Q9UBN4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRPC4Q9UBN4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRPC4Q9UBN4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRPC4Q9UBN4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRPC4Q9UBN4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRPC4Q9UBN4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRPC4Q9UBN4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRPC4Q9UBN4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRPC4Q9UBN4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms