Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
MBD5Q9P267 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
MBD5Q9P267 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
MBD5Q9P267 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
MBD5Q9P267 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
MBD5Q9P267 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
MBD5Q9P267 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
MBD5Q9P267 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
MBD5Q9P267 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
MBD5Q9P267 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
MBD5Q9P267 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
MBD5Q9P267 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
MBD5Q9P267 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC38.09■■■■□ 3.69
MBD5Q9P267 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
MBD5Q9P267 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
MBD5Q9P267 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
MBD5Q9P267 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
MBD5Q9P267 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
MBD5Q9P267 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
MBD5Q9P267 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
MBD5Q9P267 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
MBD5Q9P267 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
MBD5Q9P267 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
MBD5Q9P267 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
MBD5Q9P267 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
MBD5Q9P267 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
MBD5Q9P267 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
MBD5Q9P267 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
MBD5Q9P267 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
MBD5Q9P267 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
MBD5Q9P267 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
MBD5Q9P267 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
MBD5Q9P267 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
MBD5Q9P267 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
MBD5Q9P267 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
MBD5Q9P267 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
MBD5Q9P267 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
MBD5Q9P267 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
MBD5Q9P267 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
MBD5Q9P267 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
MBD5Q9P267 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
MBD5Q9P267 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
MBD5Q9P267 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
MBD5Q9P267 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
MBD5Q9P267 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
MBD5Q9P267 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
MBD5Q9P267 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
MBD5Q9P267 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
MBD5Q9P267 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC38.01■■■■□ 3.68
MBD5Q9P267 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
MBD5Q9P267 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
MBD5Q9P267 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
MBD5Q9P267 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
MBD5Q9P267 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
MBD5Q9P267 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
MBD5Q9P267 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
MBD5Q9P267 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
MBD5Q9P267 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
MBD5Q9P267 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
MBD5Q9P267 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
MBD5Q9P267 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
MBD5Q9P267 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
MBD5Q9P267 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
MBD5Q9P267 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
MBD5Q9P267 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
MBD5Q9P267 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
MBD5Q9P267 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
MBD5Q9P267 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
MBD5Q9P267 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
MBD5Q9P267 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
MBD5Q9P267 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
MBD5Q9P267 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
MBD5Q9P267 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
MBD5Q9P267 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
MBD5Q9P267 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
MBD5Q9P267 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
MBD5Q9P267 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
MBD5Q9P267 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC37.91■■■■□ 3.66
MBD5Q9P267 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
MBD5Q9P267 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
MBD5Q9P267 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
MBD5Q9P267 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
MBD5Q9P267 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
MBD5Q9P267 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC37.9■■■■□ 3.66
MBD5Q9P267 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
MBD5Q9P267 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
MBD5Q9P267 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC37.88■■■■□ 3.65
MBD5Q9P267 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
MBD5Q9P267 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
MBD5Q9P267 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
MBD5Q9P267 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
MBD5Q9P267 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
MBD5Q9P267 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
MBD5Q9P267 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
MBD5Q9P267 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
MBD5Q9P267 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
MBD5Q9P267 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
MBD5Q9P267 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
MBD5Q9P267 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC37.85■■■■□ 3.65
MBD5Q9P267 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms