Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC88CQ9P219 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC88CQ9P219 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC88CQ9P219 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC88CQ9P219 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC88CQ9P219 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC88CQ9P219 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC88CQ9P219 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC88CQ9P219 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC88CQ9P219 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC88CQ9P219 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC88CQ9P219 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC88CQ9P219 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC88CQ9P219 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC88CQ9P219 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC88CQ9P219 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC88CQ9P219 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC88CQ9P219 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC88CQ9P219 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC88CQ9P219 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC88CQ9P219 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC88CQ9P219 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC88CQ9P219 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC88CQ9P219 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC88CQ9P219 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC88CQ9P219 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC88CQ9P219 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC88CQ9P219 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC88CQ9P219 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC88CQ9P219 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC88CQ9P219 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC88CQ9P219 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC88CQ9P219 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC88CQ9P219 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC88CQ9P219 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC88CQ9P219 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC88CQ9P219 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC88CQ9P219 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC88CQ9P219 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC88CQ9P219 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC88CQ9P219 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC88CQ9P219 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC88CQ9P219 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC88CQ9P219 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC88CQ9P219 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC88CQ9P219 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC88CQ9P219 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC88CQ9P219 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC88CQ9P219 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC88CQ9P219 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC88CQ9P219 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC88CQ9P219 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC88CQ9P219 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC88CQ9P219 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC88CQ9P219 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC88CQ9P219 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC88CQ9P219 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC88CQ9P219 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC88CQ9P219 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC88CQ9P219 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC88CQ9P219 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC88CQ9P219 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC88CQ9P219 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC88CQ9P219 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC88CQ9P219 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC88CQ9P219 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC88CQ9P219 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC88CQ9P219 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC88CQ9P219 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC88CQ9P219 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC88CQ9P219 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC88CQ9P219 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC88CQ9P219 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC88CQ9P219 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC88CQ9P219 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC88CQ9P219 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC88CQ9P219 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC88CQ9P219 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC88CQ9P219 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC88CQ9P219 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC88CQ9P219 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC88CQ9P219 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC88CQ9P219 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC88CQ9P219 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC88CQ9P219 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC88CQ9P219 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC88CQ9P219 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC88CQ9P219 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC88CQ9P219 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC88CQ9P219 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC88CQ9P219 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC88CQ9P219 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC88CQ9P219 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC88CQ9P219 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC88CQ9P219 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC88CQ9P219 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC88CQ9P219 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC88CQ9P219 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC88CQ9P219 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC88CQ9P219 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms