Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1W8

SIRPG, Signal-regulatory protein gamma, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRPGQ9P1W8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIRPGQ9P1W8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIRPGQ9P1W8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIRPGQ9P1W8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIRPGQ9P1W8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIRPGQ9P1W8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIRPGQ9P1W8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIRPGQ9P1W8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIRPGQ9P1W8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIRPGQ9P1W8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIRPGQ9P1W8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIRPGQ9P1W8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIRPGQ9P1W8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIRPGQ9P1W8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIRPGQ9P1W8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIRPGQ9P1W8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIRPGQ9P1W8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIRPGQ9P1W8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIRPGQ9P1W8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIRPGQ9P1W8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIRPGQ9P1W8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIRPGQ9P1W8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIRPGQ9P1W8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIRPGQ9P1W8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIRPGQ9P1W8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIRPGQ9P1W8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIRPGQ9P1W8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIRPGQ9P1W8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIRPGQ9P1W8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIRPGQ9P1W8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIRPGQ9P1W8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIRPGQ9P1W8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIRPGQ9P1W8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SIRPGQ9P1W8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SIRPGQ9P1W8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIRPGQ9P1W8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIRPGQ9P1W8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIRPGQ9P1W8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIRPGQ9P1W8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIRPGQ9P1W8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SIRPGQ9P1W8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SIRPGQ9P1W8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIRPGQ9P1W8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIRPGQ9P1W8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIRPGQ9P1W8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIRPGQ9P1W8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIRPGQ9P1W8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIRPGQ9P1W8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SIRPGQ9P1W8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIRPGQ9P1W8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIRPGQ9P1W8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIRPGQ9P1W8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIRPGQ9P1W8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIRPGQ9P1W8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIRPGQ9P1W8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIRPGQ9P1W8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIRPGQ9P1W8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIRPGQ9P1W8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIRPGQ9P1W8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIRPGQ9P1W8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIRPGQ9P1W8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIRPGQ9P1W8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIRPGQ9P1W8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIRPGQ9P1W8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIRPGQ9P1W8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIRPGQ9P1W8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIRPGQ9P1W8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIRPGQ9P1W8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIRPGQ9P1W8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SIRPGQ9P1W8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIRPGQ9P1W8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIRPGQ9P1W8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIRPGQ9P1W8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIRPGQ9P1W8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIRPGQ9P1W8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIRPGQ9P1W8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIRPGQ9P1W8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIRPGQ9P1W8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIRPGQ9P1W8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SIRPGQ9P1W8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIRPGQ9P1W8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIRPGQ9P1W8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIRPGQ9P1W8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIRPGQ9P1W8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIRPGQ9P1W8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIRPGQ9P1W8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIRPGQ9P1W8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIRPGQ9P1W8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SIRPGQ9P1W8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIRPGQ9P1W8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIRPGQ9P1W8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIRPGQ9P1W8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIRPGQ9P1W8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIRPGQ9P1W8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIRPGQ9P1W8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIRPGQ9P1W8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIRPGQ9P1W8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIRPGQ9P1W8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIRPGQ9P1W8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SIRPGQ9P1W8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms