Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U3

SENP1, Sentrin-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1Q9P0U3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SENP1Q9P0U3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SENP1Q9P0U3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SENP1Q9P0U3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SENP1Q9P0U3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SENP1Q9P0U3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SENP1Q9P0U3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SENP1Q9P0U3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SENP1Q9P0U3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SENP1Q9P0U3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SENP1Q9P0U3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SENP1Q9P0U3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SENP1Q9P0U3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SENP1Q9P0U3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SENP1Q9P0U3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SENP1Q9P0U3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SENP1Q9P0U3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SENP1Q9P0U3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SENP1Q9P0U3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SENP1Q9P0U3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SENP1Q9P0U3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SENP1Q9P0U3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SENP1Q9P0U3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SENP1Q9P0U3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SENP1Q9P0U3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SENP1Q9P0U3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SENP1Q9P0U3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SENP1Q9P0U3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SENP1Q9P0U3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SENP1Q9P0U3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SENP1Q9P0U3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SENP1Q9P0U3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SENP1Q9P0U3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SENP1Q9P0U3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SENP1Q9P0U3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SENP1Q9P0U3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SENP1Q9P0U3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SENP1Q9P0U3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SENP1Q9P0U3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SENP1Q9P0U3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SENP1Q9P0U3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SENP1Q9P0U3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SENP1Q9P0U3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SENP1Q9P0U3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SENP1Q9P0U3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SENP1Q9P0U3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SENP1Q9P0U3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SENP1Q9P0U3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SENP1Q9P0U3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SENP1Q9P0U3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SENP1Q9P0U3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SENP1Q9P0U3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SENP1Q9P0U3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SENP1Q9P0U3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SENP1Q9P0U3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SENP1Q9P0U3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SENP1Q9P0U3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SENP1Q9P0U3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SENP1Q9P0U3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SENP1Q9P0U3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SENP1Q9P0U3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SENP1Q9P0U3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SENP1Q9P0U3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SENP1Q9P0U3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SENP1Q9P0U3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SENP1Q9P0U3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SENP1Q9P0U3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SENP1Q9P0U3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SENP1Q9P0U3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SENP1Q9P0U3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SENP1Q9P0U3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SENP1Q9P0U3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SENP1Q9P0U3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SENP1Q9P0U3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SENP1Q9P0U3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SENP1Q9P0U3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SENP1Q9P0U3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SENP1Q9P0U3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SENP1Q9P0U3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SENP1Q9P0U3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SENP1Q9P0U3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SENP1Q9P0U3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SENP1Q9P0U3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SENP1Q9P0U3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SENP1Q9P0U3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SENP1Q9P0U3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SENP1Q9P0U3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SENP1Q9P0U3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SENP1Q9P0U3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SENP1Q9P0U3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SENP1Q9P0U3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SENP1Q9P0U3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SENP1Q9P0U3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SENP1Q9P0U3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SENP1Q9P0U3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SENP1Q9P0U3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SENP1Q9P0U3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SENP1Q9P0U3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SENP1Q9P0U3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SENP1Q9P0U3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms